本实用新型公开了一种耐根穿刺防水卷材，包括由上至下的上保护膜层、第一化学阻根层、胎体层、第二化学阻根层和下保护膜层，第一化学阻根层和第二化学阻根层内均设置有填充孔，填充孔内填充有阻根填料。第二化学阻根层下侧也可依次设置有胎体膜层、非固化自愈自粘层和下保护膜层。该耐根穿刺防水卷材，设置有两层化学阻根层阻止植物根系生长，同时在化学阻根层内设有填充孔，填充孔内填充有生石灰阻根填料，这样即使保护膜层、阻根层和胎体层不能阻止植物根系的穿刺，照样可以通过生石灰阻断植物根系的继续生长，进一步增加阻根防水效果；另外复合了胎体膜层，胎体膜层自身就有防水和阻根性能，从而使防水卷材的防水阻根性能进一步提升。