本公开涉及一种用于液相色谱仪的流路切换阀及液相色谱仪，流路切换阀包括转子和阀头定子，转子形成有流路槽，阀头定子形成有成对的流入端口和流出端口，流路切换阀包括编码器，编码器包括编码盘和光电开关，编码盘与转子同步转动，编码盘包括柱状主体和盘体，盘体的数量为至少两个且沿轴向彼此间隔设置，每个盘体上均形成有透光开口，全部的透光开口在柱状主体的周向上均错开布置，且每个透光开口对应一对流入端口和流出端口，光电开关相对于阀头定子固定设置，光电开关与盘体上的透光开口对齐时，相应的流入端口与流出端口与流路槽连通，以实现对转子至少两个甚至多个角度位置的检测，保证对转子角度位置检测的精确性。