本实用新型公开了一种农业分层育种环保装置，属于农业生产设备技术领域，解决了现有农业育种的针对不同的习性幼苗没有不同的种植环境的问题，其技术要点是：包括装置箱体，所述装置箱体内设置有分层若干个育苗箱，所述育苗箱固定连接装置箱体，所述育苗箱内设置有细土层、固土层和砂砾层，所述细土层、固土层和砂砾层由上到下依次连接育苗箱，所述育苗箱内设置有水箱，所述水箱设置在砂砾层下方，所述水箱内设置有若干个陶瓷吸水棒，所述陶瓷吸水棒均匀分布在水箱内，所述陶瓷吸水棒贯穿砂砾层，具有针对不同的习性幼苗有不同的种植环境的优点。