本实用新型涉及临床医学检测设备技术领域，公开了一种底物采集装置，包括导向组件、瓶盖组件以及底物瓶，所述支架上设置有底物瓶放置区；所述瓶盖组件设置于导向组件上，通过导向组件控制瓶盖组件的运动。本实用新型提供的底物采集装置，通过使用硬直管作为底物采集管，可以很好地控制底物管插入底物瓶的深度，从而可以很好的控制底物残余量，同时避免了使用常规软管弯曲的问题，彻底解决底物管插入到底物瓶时出现不好插进去甚至插不进去的问题。