本实用新型涉及一种菌种粉碎机，包括支架，支架上安装锥形料斗，料斗的下部转动安装两个切碎轴，切碎轴上连接多个切刀，切碎轴的一端伸出料斗并连接传动齿轮，料斗的侧壁上安装步进电机；料斗的底部固定连接出料管，出料管内转动安装出料轴，出料轴设置螺旋叶片，出料管的一端固定连接电机安装座，电机安装座上安装出料电机，出料电机与出料轴传动连接，本实用新型通过独特的结构设计，实现菌种的机械粉碎，提高了菌种的粉碎效率；本实用新型的出料方式采用在出料轴上设置螺旋叶片，从而通过出料轴的转动使粉碎后的菌种通过固定的出料口固定出料，避免了直接出料存在的飞溅，也更加便于集中收纳，便于粉碎后的集中打包。