本实用新型适用于生物实验设备技术领域，提供了一种生物样本自动化解冻系统，包括解冻结构和弹管结构；解冻结构包括加热块，加热块的中部设有加热孔，加热孔沿加热块的上下方向贯通；弹管结构包括下压块，下压块的顶部抵接冻存管的底部，下压块的下部连接弹性组件，下压块的底部对应设有吸附件。借此，本实用新型通过两个温度传感器精确控制冻存管的加热温度和时间，并通过弹管结构快速弹出解冻完成的冻存管，通过抱紧结构使冻存管和加热孔紧密接触，快速升温，缩短细胞解冻时间，降低细胞死亡率。