本申请涉及一种水利工程闸门结构，包括位于两侧坝体之间并垂直抵触于河底的涵闸门，涵闸门远离蓄水区一侧的侧壁设置有多个用于翻转所述涵闸门的翻转机构，翻转机构包括翻转板、固定板、齿条、齿轮、液压缸以及连杆，翻转板固接于涵闸门的侧壁上，固定板固接于河底上，齿条固接于翻转板远离涵闸门一侧的侧壁上，齿轮转动设置于固定板靠近翻转板的一端，齿轮与齿条相互啮合，液压缸位于齿条的上方并固接于翻转板和固定板之间，齿条的两侧对称设置有连杆，连杆的两端分别转动连接于固定板和翻转板的侧壁上，且连杆位于固定板上一端的高度高于位于翻转板上一端的高度。本申请能够减少因较大水压造成的闸门发生形变，延长涵闸门的使用寿命。