本实用新型公开了一种主轴单元密封机构，包括主轴本体的两侧均滑动穿插连接有密封筒，所两个密封筒相对的一侧均固定连接有环形板，其中一个环形板的一侧呈环形阵列固定连接有多个连接杆，其中另一个环形板上开设有多个与连接杆相配合的通槽，其中另一个环形板的一侧呈环形阵列开设有多个凹槽，凹槽的内腔设置有滑动块，滑动块的底端固定连接有两个拉簧，滑动块的一侧固定连接有限位板，连接杆一侧的顶部开设有卡槽，限位板的一端与卡槽的内腔滑动穿插连接。本实用新型利用密封筒、连接杆和限位板的相互配合，从而便于对主轴本体的表面进行保护，避免腐蚀性液体直接接触主轴本体，从而便于对主轴本体进行保护。