本实用新型涉及医疗废弃物处理技术领域，具体涉及一种车载撬装式医疗废弃物处理系统，回收车辆包括集装箱体和车架底盘；车架底盘前端与车头之间设置抓取机械臂；集装箱体内设置有粉碎装置，粉碎装置包括进料仓，集装箱体上设置有封闭进料仓的封闭装置；粉碎装置出料口与低温炭化炉进料口连通，与低温炭化炉配合设置有空气分离装置和冷能收集器；低温炭化炉出料口与集装箱体尾部设置的主料仓连通；集装箱体内还设置有空气净化装置；空气净化装置通过与之连通的负压装置与冷能收集器连通。本实用新型设计合理新颖，结构紧凑，集成化程度高，实现对医疗废弃物的收集、无害化处理、减量化处理，大幅降低医疗废弃物的装运成本。