本实用新型实施例公开了一种双波长激光器，包括泵浦源、基频光产生模块以及倍频光输出模块；基频光产生模块设置于泵浦源的输出端，吸收泵浦源出射的泵浦光，输出基频光；倍频光输出模块设置于基频光产生模块的输出端，包括位置调整单元和沿输出光路方向依次排布的基频光二分之一波片、倍频晶体、第一基频光偏振片和倍频光偏振片；倍频光输出模块在位置调整单元将基频光二分之一波片和倍频光偏振片移出光路时输出基频光，在位置调整单元将第一基频光偏振片移出光路时输出倍频光。本实用新型实施例提供的双波长激光器，可实现基频光和倍频光自由切换且同轴输出，光路结构简单紧凑，使用操作灵活方便，可节约生产成本，降低用户使用难度。