本申请公开了一种藻蓝蛋白过滤膜的清理装置，包括：过滤室，支撑台、进料口，进料口设置于过滤室的顶端，支撑台安装于过滤室的外壁，支撑台上设置有滑轨，滑轨的尾端设置有挡板，支撑台上还设置有控制器，过滤室内设置过滤膜，过滤室的外侧壁上设置有通孔，通孔位于设置支撑台的一侧；过滤膜上方设置有清洗器，清洗器包括电动推杆、连杆、刷头、刮板，电动推杆的电机底部设置有在滑轨上滑行的滑轮，连杆安装于电动推杆的轴头上，刷头和刮板安装于连杆的底部，电动推杆的电机与控制器连接，在过滤室的侧壁上还设置有掏渣口。该清理装置解决了现有技术中人工对藻蓝蛋白过滤膜进行清理，较费时费力，而且效率低的问题。