本实用新型的一种医院污泥杀菌净化系统，属于医院污水处理设备技术领域，包括杀菌池、输液泵和生物净化池，杀菌池的左侧上段设有进液管道，还包括搅拌震动机构、污泥处理机构、生物净化机构和过滤网；杀菌池的顶部设有矩形通道，矩形通道的顶部设有封闭盖；生物净化机构包括有高度调整组件和三个安装框，每个安装框上均设有生物棉网，每个生物棉网上均附着有微生物和微生物酶。本实用新型通过固液分离膜能够对污泥与污水有效进行分离，使压缩板能够对滤除在固液分离膜上的污泥进行压缩，来减少污泥的占用空间，并且通过生物净化机构能够间歇调整所有生物棉网的高度，以便于对生物净化池内不同深度的污水进行净化处理。