本实用新型公开了一种防止样品被污染的气相色谱仪，属于化学分析技术领域，包括主体，所述主体顶端外壁一侧中间固定安装有样品存放箱，且样品存放箱内壁上端固定安装有抽拉杆，多个所述抽拉杆伸缩端固定安装有弹性套，且弹性套内部固定套接有样品瓶，所述样品存放箱内壁中间固定安装有固定板。本实用新型中通过样品瓶固定置于样品存放箱内部，样品存放箱内部设置有紫外消毒灯和抽气管，使得样品存放箱始终处于灭菌真空的状态，进而将样品瓶外壁和针筒的针头进行消毒，避免取样时样品被污染，同时针筒与导管、进气管依次固定连接，从取样到进样样品处于密闭的环境中，未与外部元素接触，避免样品被污染。