一种操作介质扫描器以保护目标机器免受可移动存储设备上的恶意软件的影响的方法。目标机器和可移动存储设备均包括相应的数据线，并且介质扫描器包括数据开关。使用介质扫描器的恶意软件检测软件经由第一数据路径在可移动存储设备上扫描数据，该第一数据路径包括可移动存储设备的数据线通过处于第一开关状态的数据开关连接至介质扫描器的数据线。在使用恶意软件检测软件扫描了数据之后，操作数据开关以从第一开关状态切换到第二开关状态，从而将可移动存储设备的数据线与介质扫描器的数据线断开连接并且将可移动存储设备的数据线连接至目标机器的数据线。数据经由第二数据路径从可移动存储设备传输至目标机器，该第二数据路径包括可移动存储设备的数据线通过处于第二开关状态的数据开关连接至目标机器的数据线。在设备被移除之后，将数据开关返回至该数据开关的第一开关状态。