本发明公开了一种具有多加工基准面的航天摩阻传感器表头结构加工方法。该加工方法适用于基于K形管压差测量原理的航天摩阻传感器的表头结构，表头结构的表头基体为上小下大的偏心圆台结构，上表面沿气流方向设置有竖直的直孔和斜向下方的斜孔，斜孔具有倾角α；直孔设置有底部连接直孔Ⅰ；斜孔设置有底部连接直孔Ⅱ。该加工方法包括以下步骤：加工辅助工装，加工基准面Ⅰ，加工基准面Ⅲ，加工直孔，加工基准面Ⅱ，加工斜孔去除辅助工装，加工底部连接直孔Ⅰ和底部连接直孔Ⅱ，修型。该加工方法采用多加工基准面实现了在同一平面加工两个呈较小夹角的细长孔，降低了加工难度，提高了加工精度，进而提升了航天摩阻传感器的测量精准度。