一种基于mvAUC的互补差异表达基因选取方法
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摘要

本发明提出一种基于多变量AUC的特征选择方法,从癌症的差异表达数据中选择最互补的基因子集,实现全局分类性能最大化。本发明首先基于特征的可能误分类集提出一种AUC计算的新角度;然后对于一个特征集,确定其共同可能误分类集并计算每个特征组合后的新AUC;一个特征的新AUC与原始AUC的差值展示了组合后特征集中的其他特征对该特征分类能力的互补作用。最后基于特征组合后的新AUC计算mvAUC,并增量式的选择使当前mvAUC最大化的候选特征加入被选特征子集。本发明方法具有可以直接评估被选特征子集的全局类辨别能力的优点,不需要成对地计算候选特征和每个被选特征之间的冗余信息。

基本信息
专利标题 :
一种基于mvAUC的互补差异表达基因选取方法
专利标题(英):
暂无
公开(公告)号 :
CN112802555A
申请号 :
CN202110147526.2
公开(公告)日 :
2021-05-14
申请日 :
2021-02-03
授权号 :
CN112802555B
授权日 :
2022-04-19
发明人 :
卫金茂苏月杜科宇刘健
申请人 :
南开大学
申请人地址 :
天津市津南区同砚路38号南开大学计算机学院
代理机构 :
北京东方盛凡知识产权代理事务所(普通合伙)
代理人 :
王颖
优先权 :
CN202110147526.2
主分类号 :
G16B40/20
IPC分类号 :
G16B40/20  G16B25/00  
IPC结构图谱
G
G部——物理
G16
特别适用于特定应用领域的信息通信技术
G16B
生物信息学,例如特别适用于计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关数据处理的信息与通信技术
G16B40/00
特别适用于生物统计学的ICT;特别适用于与生物信息学相关的机器学习或数据挖掘,例如知识发现或模式发现的ICT
G16B40/20
监督数据分析
法律状态
2022-04-19 :
授权
2021-06-01 :
实质审查的生效
IPC(主分类) : G16B 40/20
申请日 : 20210203
2021-05-14 :
公开
注:本法律状态信息仅供参考,即时准确的法律状态信息须到国家知识产权局办理专利登记簿副本。
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