本发明公开了一种异型钢结构弯扭构件用辅助定位系统及其定位方法，属于钢结构用具领域。本发明的辅助定位系统，包括夹持单元和胎架单元，夹持单元用于夹持在弯扭构件的外面板和内面板两侧，胎架单元用于从底部支撑弯扭构件的下面板；沿弯扭构件的长度延伸方向，分别间隔设置有多组夹持单元和胎架单元。本发明克服现有技术中针对异型钢弯扭构件缺乏有效定位支撑的问题，利用本发明的辅助定位系统可以进行有效支撑定位，解决弯扭构件壁板的组装定位问题，消除加工误差，提高加工精度，且本发明的定位方法操作简便，易于推广，成本较低。