本发明属于流体机械领域，涉及一种轴向力可自动平衡的离心式压缩机结构，包括：一级蜗壳、二级蜗壳分别安装在电机壳体的两端，主轴的两端背靠背分别安装有一级叶轮和二级叶轮，一级叶轮和二级叶轮分别位于一级蜗壳、二级蜗壳内；电机壳体和一级蜗壳之间设有一级轴封，电机壳体和二级蜗壳之间设有二级轴封。本发明通过调整一级轴封和二级轴封的进气压力控制一级叶轮和二级叶轮的轮背压力，分别与一级叶轮的前后压差所产生的轴向力和二级叶轮的前后压差所产生的轴向力平衡掉，避免了离心式压缩机由于轴向力不平衡而导致的磨损和故障，提高压缩机的性能和使用寿命。同时可以轮背作为止推盘，取消止推轴承，提高叶轮定位精度和整机的紧凑性。