一种空调电池联合加热系统的热量分配控制系统，包括：具有第一泵和放热器的车内加热回路、具有第二泵和电池换热器的电池加热回路以及将车内加热回路与电池加热回路分别连结的两条支路；在车内加热回路上设置有热源；在两条支路与车内加热回路和电池加热回路连结的至少一个连结点上配置有三通流量调节阀；在放热器的入口侧配置有第一温度传感器，在电池换热器的入口侧配置有第二温度传感器；还包括控制器，控制器基于第一温度传感器和/或第二温度传感器的检测值，调节热源的输出以及三通流量调节阀的开度。本发明在同时加热车室内和电池时，能兼顾空调侧和电池侧不同的加热需求。