本发明公开了一种电主轴中心冷却结构，包括上壳体具有第一通道，顶端压盖具有第二通道，旋转连接件具有相互独立的第三通道和第四通道，旋转轴具有相互独立的第五通道和第六通道，滑动轴具有相互独立的第七通道、第八通道和第九通道，分水套具有第十通道，电主轴具有第十一通道，隔套套设于旋转连接件外且两者形成第十二通道，限位套套设于旋转连接件外且两者形成第十三通道，下壳体还具有与第一腔体连通的第十四通道和第十五通道，各通道连通形成通路，第十四通道与通路连通，第十五通道与通路连通。本发明通过冷却液在通路内形成回路对电主轴内部进行冷却，大幅改善电主轴内部的发热情况，提高电主轴的使用寿命。