本发明公开了一种松软、低透、高硫化氢煤层分区钻割注碱治理施工方法，包括1)探测及区域划分；2)注碱参数设计；3)水力割缝钻孔；4)封孔；5)钻孔注碱；6)注碱效果考察及水力割缝钻孔参数调整；7)在采煤过程中实时检测硫化氢涌出量，根据硫化氢浓度检测仪测定硫化氢浓度，根据监测结果修改步骤3)中的水力割缝间距，同时调整注碱量和钻孔数量，保证其它区域煤层回采时硫化氢浓度低于安全值6.6ppm。本发明采用水力割缝钻孔一体化技术扩大煤层注碱量和治理范围，并且根据不同硫化氢含量区域采用不同的水力割缝布置方式，可以极大地提高治理煤层硫化氢的效率，同时保证井下作业人员和相关设备免受硫化氢的危害。