本发明公开了一种基于人工智能的水声信号调制识别方法及系统，其中方法包括：获取水声信号，并采用对应的调制方式进行调制以得到对应的已调信号；将已调信号发送到水声信道中以在水声信道中截获多个已调信号，并进行预处理以得到多个处理信号；提取每一个处理信号对应的多类特征参数，并进行融合及数据处理以得到多特征图，以及基于短时傅里叶变换进行频谱特征提取以得到功率谱图；建立调制识别模型，并从多特征图和功率谱图中抽取一部分数据对调制识别模型进行训练；将多特征图和功率谱图中剩下的另一部分数据输入到训练好的调制识别模型，以得到识别结果及其识别准确率；从而不仅降低了算法复杂度，而且还提高了调制识别的准确率。