本发明公开了一种药柱包覆凝胶飞边整修装置及其整修方法。该装置包括水平底座，所述水平底座上设置有用于安放药柱的水平转盘，所述水平转盘的一侧设置有可在水平底座上左右滑动的垂直立柱，所述垂直立柱上部设置有朝向水平转盘一侧悬空布置、且能沿垂直立柱上下滑动的刀柄组件，所述刀柄组件的头部中间设置有水平悬空布置、且能测定药柱顶部中心高度的探块组件，所述刀柄组件的头部上表面设置有水平悬空布置、用于水平切削药柱的包覆凝胶飞边的上刀片组件，所述刀柄组件的头部下表面设置有倾斜向上布置、用于斜向切削药柱的包覆凝胶飞边的下刀片组件。该整修装置及整修方法适用药柱范围广，飞边切削效果好，保证了药柱质量同时提高了生产效率。