本发明涉及吻合器技术领域，公开了一种腔镜切割吻合器，包括执行端和手动部件，所述执行端通过延伸管与所述手动部件连接，所述执行端前端设置有钉仓和抵钉座，所述抵钉座上表面设置有钉槽，所述钉仓顶部设置有压紧连杆，所述执行端靠近所述延伸管的一端设置有驱动仓，所述抵钉座靠近所述驱动仓的一侧设置有导向槽。该腔镜切割吻合器，通过导向槽在钉仓向下转动时，转至水平状态后，钉仓尾端的导向块进入导向槽内部，钉仓与抵钉座处于平行状态，在进一步的合并时，钉仓受导向槽和导向块限制，始终只能进行垂直向抵钉座方向移动，进而达到钉仓和抵钉座夹住肠壁时不会出现执行端尾部夹紧顶部夹不紧现象，避免手术时出现夹持不紧导致手术不合格。