本发明公开了一种水槽主动吸收式造波机系统及控制方法，其系统包括首端主动吸收式造波机、尾端主动吸收式造波机、反射率测定装置、中央伺服控制器、计算机，水槽首尾两端各布置主动吸收式造波机，波高传感器分别布置于两端的造波板上，用于实时反馈板上的波高数据，采用一台中央伺服控制器同时控制两端的伺服电机驱动造波板运行。该方案使得所有的运行数据和反馈数据实现同步采集及运算，实现高性能消波的同时，进行高精度的波浪模拟。同时采用本发明提供的控制方法能够实现高效率的反射波吸收，并能适应更宽的波谱范围，满足在长度短的水槽中，模拟精度高、波高大的实验使用需求。