本发明属于土壤改良技术领域，公开了一种设施农业土壤重金属镉和连作障碍修复的方法，包括：对土壤样本进行重金属含量及成分分析；基于土壤中重金属的含量及土壤成分分析结果进行土壤修复剂的制备；向待修复土壤中施加制备的土壤修复剂，将土壤旋耕混匀并整平；利用预先处理的地下水进行土壤浇灌；向浇灌后的土壤中播种修复植物，收割植物即可。本发明利用活性炭等环境友好材料结合修复植物进行土壤修复，能促进农田养分的自然循环，达到治理土壤环境污染的目的，实现农产品安全的源头控制，全面提升农产品质量安全水平，降低镉离子可交换量，稳定镉离子，改变设施农业土壤中的重金属镉形态，降低土壤重金属镉的有效性，减少作物对镉的吸收。