本发明提供了一种红系特异性的人β珠蛋白基因启动子、表达人β珠蛋白的重组序列及其应用，属于基因工程技术领域。本发明提供了一种红系特异性的人β珠蛋白基因启动子，核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示，具有高效及红系特异性启动功能基因表达的特点。本发明还提供了一种在红系细胞中特异表达人β珠蛋白的重组序列，为人的β珠蛋白基因座控区HS3～1‑β珠蛋白基因启动子‑β珠蛋白基因‑β珠蛋白基因增强子。通过构建表达所述重组序列的重组载体，在红系细胞中验证表明，所述重组序列能够高效特异表达人β珠蛋白基因，为β地中海贫血基因治疗提供了基础和实验参考，对治疗地中海贫血具有重要意义，同时对研究β珠蛋白的表达调控研究提供方法支持。