本发明涉及一种高灵活性的非晶合金表面大面积微结构制备方法，属于材料表面微结构制备技术领域。包括以下步骤：(1)对非晶合金材料表面进行研磨抛光处理，之后清洗并吹干；(2)以氩气作为保护气体，对步骤(1)所得的非晶合金表面以设定的激光辐照参数进行纳秒激光点辐照，获得单点微凸起结构；(3)测得单点微凸起结构的直径，并根据所需制备大面积微结构的形状和尺寸要求确定相邻辐照点间的相对位置，随后在计算机软件中绘制相应的图案；(4)借助于计算机程序控制激光束的轨迹实现步骤(3)中绘制的图案的加工。本发明可在非晶合金表面灵活地制备出具有不同形状和尺寸的大面积微结构，在仿生表面科学、模具成型、表面润湿性调控等领域有着巨大的应用前景。