本发明涉及一种全自动免疫组化染色仪及其染色方法，该全自动免疫组化染色仪，包括机架、染色盒组件、试剂瓶组件、移动加样针、通用试剂加样组件及废液收集盒；染色盒组件安装于机架上，其包括染色盒及用于驱动其晃动的驱动机构，染色盒安装于驱动机构上，染色盒包括容器与盖体，容器的两侧壁上分别设有用于安装玻片的开口及用于排液的排液口，废液收集盒设于染色盒的排液口侧；试剂瓶组件安装于机架上，其包括试剂瓶架与试剂瓶，试剂瓶架顶部均匀开设有用于安装试剂瓶的容纳槽，试剂瓶用于承装不同的试剂；通过运动装置强化组织与试剂的接触效率，缩短一抗、二抗的反应时间，适宜进一步推广应用。