本发明公开了一种肝素帽自动化生产线，包括组装输送线和铝塑板输送线，铝塑板输送线和组装输送线同步运行，在铝塑板输送线和组装输送线的交接处，设置装料装置；沿组装输送线的输送方向，依次设置基座上料装置，胶塞上料器，胶塞压合装置，定量灌装装置和热封装置，沿铝塑板输送线的输送方向，依次设置铝塑板上料装置以及铝塑板热封切断装置；本发明构建了肝素帽生产全流程的自动化产线，对包装材料兼容成品铝塑板和铝塑板卷料，同时兼顾了各种体量的实际生产需求，适合于产品的降本提质增效，实现了全自动生产，提升了产品质量，提高了生产效率，极大的节约了人工成本，适应了现代生产的要求，即提高了产品竞争力，又节约了生产成本。