本发明公开了一种湖沼最优格局的确定方法及其模拟实验装置，包括以下步骤：S1、提出理论计算方法；S2、通过模拟实验装置确定湖沼生态需水计算公式中参数的系数，通过数值模拟确定湖沼生态用地的计算公式中参数的系数，通过满足湖沼系统生态服务价值最大和缺水量最小的条件来确定湖沼最优格局的计算公式中参数的系数；确定上述系数后，根据计算公式来确定湖沼最优格局；S3、通过实际观测来验证该计算方法。本发明综合考虑水位、水温、流速、降水量、径流量、蒸散发量、鱼类生境需求、鸟类生境需求、生态服务价值等多种变量，能较好判定湖沼最优格局，可为争水争地矛盾下湖沼最优格局研究提供重要参考，为湖沼系统高效用水用地提供了方法支撑。