本发明公开了智能呼吸训练系统、控制系统及控制方法，智能呼吸训练系统包括依次连接的的流体设备、净化设备、气体分离装置、气体混合器和加湿器，还包括通信组件、生理参数监测仪和控制器，控制器通过通信组件连接生理参数监测仪，净化设备连接有压力传感器，气体分离装置具有第一出口和第二出口，气体分离装置通过第一阀门和第二阀门连接气体混合器，气体混合器连接有氧气传感器，加湿器连接有温湿度传感器，流体设备、加湿器、第一阀门和第二阀门均连接控制器。本发明针对现有呼吸训练设备的气体控制不够精细灵活、结构复杂、可靠性低、气流不能稳定输出等问题提出新颖的设计方案，能够稳定地调节气体流量、含氧量和气压，并能输出稳定气流。