本发明公开了一种从褐煤中综合提取稀有元素及有机质等有价组分的方法，该方法主要包括以下步骤：(1)原煤破碎；(2)氧化预处理，初步释放褐煤中含有的稀有金属如锗、镓、稀土等；(3)加温碱处理，深度释放褐煤中的稀有金属，并溶解出褐煤中的碱溶性有机质；(4)控电位酸处理，从碱处理液中沉淀出酸不溶有机质，并促进有机质所络合稀有金属的解析；(5)废水处理与循环，处理工艺中提取稀有金属后残余酸液与碱处理过程残余碱液的中和与循环；本发明在兼顾生产成本的前提下，进行褐煤中稀有金属提取的同时，实现褐煤中残余有机质的产品化，残余固体量少且易于建材化，处理过程中残余酸碱溶液大部分可流程内处理并循环使用，工艺流程具有环境污染少、经济效益高、有价组分综合利用率高的优势。