本发明涉及一种柔性直流配电网后备保护加速方法及系统，预设柔性直流配电网中每个断路器的跳闸延时时间，对第一电流突变量的极性为负的断路器进行保护闭锁，当故障线路一端的断路器到达跳闸延时时间时执行跳闸，断开故障线路的一端，当第二电流突变量的极性仍为正时，可以确定故障位于本处断路器的正方向，缩短该处断路器的跳闸延时时间，当故障持续时间到达缩短后的第三跳闸延时时间时执行跳闸动作，断开故障线路的另一端。本发明在故障电流被稳定控制的条件下，根据故障线路一侧开关断开产生的电流突变量极性加速跳开另一侧开关，能够大大缩短后备保护的动作时间，更快地切除故障线路，提高保护速动性。