本发明公开了一种湖库底层低扰动供氧修复设备及方法，修复设备包括水泵、密闭过滤池、压力钢管、溶氧装置和普通压力管；所述水泵与密闭过滤池之间通过普通压力管连接，所述密闭过滤池和溶氧装置之间通过压力钢管连接；所述水泵通过普通压力管接入湖库水体中，所述溶氧装置通过普通压力管接入湖库底层；所述水泵用于将湖库中的水泵入密闭过滤池中，所述密闭过滤池内填充有填料，用于将泵入的水进行过滤，所述溶氧装置用于将氧气融入水体，形成高溶氧水体。本发明对沉积物上覆水体的氧环境改善效果显著，有效降低了二次污染的风险，改善了水环境。