本文提供了一种低渗透岩石的相对渗透率测定系统及方法，所述系统包括：岩心夹持器用于固定岩心，岩心夹持器上设有至少一个压力阀，每个压力阀与岩心夹持器入口相连；围压装置用于给岩心提供预设围岩环境；注入装置与岩心夹持器的入口端连接，用于向岩心注入驱替液体；压差传感器设置于压力阀与岩心夹持器的连接线路上，用于获得压力阀至岩心夹持器入口处的压力差；CT扫描仪用于采集岩心在每个预设位置的CT值；计算装置用于在岩心处于非稳定状态下，接收压差传感器和CT扫描仪的采集数据，并结合预先测量的岩心在每个预设位置的孔隙度，计算获得每个压力阀位置对应的相对渗透率，本文能提高了对岩心相对渗透率测定的准确性。