本发明公开了一种可交错缝合的腔镜吻合器，包括机壳、摆头、上夹头和钉槽，所述机壳内部后侧开设有第一滑槽，且第一滑槽内部转动连接有螺杆，所述螺杆右端贯穿机壳与驱动电机相连接，且驱动电机固定安装在机壳右侧，所述机壳内部前侧开设有与第一滑槽相连通的第二滑槽，且第一滑槽内部滑动连接有第一滑块。该可交错缝合的腔镜吻合器，设置有上夹头、下夹头和钉匣，上夹头与下夹头内部均卡接有钉匣，同时上夹头内部钉匣的缝合钉位置与下夹头内部钉匣的缝合钉位置呈交错设置，使得上夹头内部缝合钉以及下夹头内部缝合钉配合完成缝合时，缝合在患者身体组织的上下两侧交错缝合，提高了对缝合效果，使用起来更具有实用性。