本发明涉及一种内嵌阴极动态膜强化短程硝化反应器的方法，包括以下步骤：准备连续流反应器、驯化成功的短程硝化污泥、动态膜组件、铁板、电化学工作站、进水槽、蠕动泵、曝气泵、压差计和出水泵；在连续流反应器中安装动态膜组件，动态膜组件内采用不锈钢内衬作为阴极，铁板作为阳极，阴极和阳极分别连接电化学工作站；在连续流反应器内设置曝气泵，加入短程硝化污泥；连续流反应器采用连续进水方式运行，控制进水高氨氮负荷、低溶解氧浓度，并分时段间歇曝气，控制曝气强度；结合采用控制电流、通电时间的电化学手段强化反应器运行效果、增加与短程硝化相关的菌属含量，降低膜污染速率。该方法有利于降低膜污染速率，延长膜运行周期。