本发明提供了一种基于人工智能的内镜检查辅助系统。该系统包括：检查数据采集模块，被配置为通过内镜设备获取检查数据，所述检查数据至少包括检查时间数据和检查图像数据；检查质量监测模块，被配置为对所述检查数据进行数据处理，所述数据处理至少包括数据统计和数据分类，然后将特定类型的检查数据分别输入相应的基于神经网络构建的质量监测模型中，以确定检查质量；检查辅助模块，被配置为基于所述检查图像数据所对应的部位或对象，将所述检查图像数据分别输入对应的基于神经网络构建的识别模型中得到用于辅助操作的标识，将所述标识与对应的检查图像数据按照预设方式输出。