本发明公开了独立式电动车控制器，包括控制器本体、导流机构、防尘机构、自锁机构、卡扣机构和导热机构，所述控制器本体包括下壳体、设置于下壳体上可拆卸的上壳体、设置于下壳体内的电子元件、固装于上壳体上的单片机以及设置于上壳体一侧的湿度传感器，所述导流机构包括分别设置于上壳体两侧可拆卸的进气管和出气管、可转动安装于进气管内的传动轴、固接于传动轴端部的扇叶、固接于上壳体内的导流板，用于过滤导流机构导入上壳体内部的空气，所述自锁机构位于进气管内部，用于制止传动轴的运行，所述卡扣机构位于进气管的接口处，用于导流机构的安装和拆卸，所述导热机构位于下壳体底部，用于对电子元件进行温度交换。