本发明公开了一种出屋面管道防水封堵结构及施工方法，属于建筑施工技术领域。本发明，包括预埋在屋面结构层内部且带有止水翼环的钢套管，浇筑在钢套管和出屋面管道之间的聚合物防水砂浆一，平铺在屋面结构层上方的找平层，粘结在找平层上表面以及钢套管外侧的防水卷材，密封在防水卷材和聚合物防水砂浆顶部的沥青基密封膏，套装在防水卷材外侧且内壁与防水卷材预留有间隙的镀锌管，和浇筑在镀锌管和防水卷材之间以及覆盖在沥青基密封膏顶部的聚合物防水砂浆二。通过对钢套管与出屋面管道之间有效封堵、防水卷材上翻到钢套管顶面以及对翻包到钢套管上的防水卷材进行有效保护等措施来实现出屋面管道的防水效果，保证管道处不渗漏。