本发明公开了一种植物源复配抑菌剂，所述抑菌剂由牡丹花提取物和花椒果提取物按质量百分比复配而成，其中牡丹花提取物含量为20％‑50％，花椒果提取物含量为50％‑80％。本发明的植物源复配抑菌剂，抗菌谱广、抑菌作用强，对革兰氏阳性菌、革兰氏阴性菌、酵母菌以及霉菌，具有较宽的抑菌谱，且充分体现复配物协同增效的作用，克服单一植物提取物在抑菌效力上的局限性。该植物源复配抑菌剂的防腐能力与化学抑菌剂尼泊金丙酯的作用基本相当，可替代传统的化学防腐剂的使用。通过实验初步表明该植物源复配抑菌剂通过作用于细菌的细胞壁、细胞膜、核酸以及酶蛋白等不同部位，协同作用，提高组合物的抑菌能力。