基于PMA高通量测序和PICRUSt的抗生素抗性基因及潜...
授权
摘要
本发明提供了一种基于PMA高通量测序和PICRUSt的抗生素抗性基因及其潜在宿主细胞的鉴定方法，属于环境样品中新兴基因型污染物及其宿主细菌的鉴定技术领域。该方法包括如下步骤：一.针对环境样品使用PMA‑高通量测序技术，获取活微生物的物种注释信息；二.使用PICRUSt功能预测软件结合ARGs的KOs数据集鉴定ARGs；三.ARGs潜在活性宿主细菌鉴定，相较于以宏基因组测序为主的ARGs检测，有效的降低了ARGs的检测成本，提高了检测的全面性；最终实现了ARGs鉴定并溯源了ARGs的活性宿主细菌。本发明为解决在现有新兴基因型污染物在环境样品中检测费用较高，检测不全面以及活性宿主细菌的鉴定问题提供了方法。
基本信息
专利标题 ：
基于PMA高通量测序和PICRUSt的抗生素抗性基因及潜在宿主细胞的鉴定方法
专利标题（英）：
暂无
公开（公告）号 ：
CN113493847A
申请号 ：
CN202110707911.8
公开（公告）日 ：
2021-10-12
申请日 ：
2021-06-24
授权号 ：
CN113493847B
授权日 ：
2022-04-19
发明人 ：
樊晓燕张忠兴高玉玺赵君如徐是龙
申请人 ：
北京工业大学
申请人地址 ：
北京市朝阳区平乐园100号
代理机构 ：
北京思海天达知识产权代理有限公司
代理人 ：
张立改
优先权 ：
CN202110707911.8
主分类号 ：
C12Q1/689
IPC分类号 ：
C12Q1/689 C12Q1/6869
IPC结构图谱
C
C部——化学；冶金
C12
生物化学；啤酒；烈性酒；果汁酒；醋；微生物学；酶学；突变或遗传工程
C12Q
包含酶、核酸或微生物的测定或检验方法；其所用的组合物或试纸；这种组合物的制备方法；在微生物学方法或酶学方法中的条件反应控制
C12Q1/64
•地质微生物试验，如用于石油
C12Q1/68
包括核酸
C12Q1/6876
用于核酸分析的核酸产品，如引物或探针
C12Q1/6888
用于生物体的检测与识别
C12Q1/689
用于细菌
法律状态
2022-04-19 ：
授权
2021-10-29 ：
实质审查的生效
IPC(主分类) : C12Q 1/689
申请日 : 20210624
申请日 : 20210624
2021-10-12 ：
公开
注：本法律状态信息仅供参考，即时准确的法律状态信息须到国家知识产权局办理专利登记簿副本。
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