本发明公开了一种大高径比多层薄壁焊接机匣组焊方法，包括以下步骤，步骤1，根据焊接机匣的结构，确定分部组焊方案；步骤2，在组焊的焊接零件上增设焊接收缩余量；步骤3，依据步骤1中的分部组焊方案，在焊接零件的焊接部位设置工艺安装边和工艺止口；步骤4，根据步骤1的分部组焊方案进行焊接加工；步骤5，对焊接加工后的焊接零件进行检查、修正变形；步骤6，去除焊接加工后焊接零件上的工艺安装边；步骤7，循环进行步骤4至步骤6，完成大高径比多层薄壁焊接机匣的焊接加工。通过焊接机匣的结构进行分部组焊设计，降低了组装焊接难度，可在组焊各部分时，逐步校正焊接变形，分阶段修正各层之间的各向尺寸及形位关系。