本申请提供一种系统升级方法、装置、电子设备及存储介质，涉及升级技术领域，具体方案包括：获取待升级系统的第i个升级包，从处于挂载状态的临时文件中获取第一差异数据以及从用户只读空间中获取源版本的原始数据；根据所有第一差异数据、源版本的原始数据和第i个升级包，得到第二差异数据，存储第二差异数据至临时文件中；响应重启指令，根据临时文件中的所有差异数据和源版本的原始数据，启动待升级系统；响应待升级系统成功启动，将临时文件中的所有差异数据写入到用户只读空间中，所有差异数据和源版本的原始数据合并为待升级系统的目标数据，目标数据指向待升级系统的目标版本，实现一次重启升级多个升级包，降低耗时，从而提高升级效率。