本发明涉及一种基于有机朗肯循环的燃料电池余热发电系统，包括燃料电池冷却系统、有机朗肯循环装置和金属氢化物系统；燃料电池冷却系统包括，与电堆连接的冷却液管道，冷却液管道依次连接有机朗肯循环装置中的透平机和金属氢化物系统中的金属氢化物储存罐；有机朗肯循环装置包括相连接的发电机和透平机；金属氢化物系统包括相连接的金属氢化物储存罐和氢气罐，氢气罐与电堆连接。燃料电池的电堆的冷却装置被有机朗肯循环装置代替，电堆中的热量直接加热有机朗肯循环中的有机工质，电堆阴极的排气热量预热有机工质，引入了金属氢化物储存罐，吸收热力循环中的乏汽能量生成金属氢化物，提高能量利用效率的同时简化了系统结构。