本发明公开了一种管片式散热器自动穿管加工装置，涉及散热器穿管加工技术领域，包括加工底座、固定侧架以及传动机构；所述加工底座上设置有散热片固定组件，所述加工底座上位于散热片固定组件的两侧分别滑动设置有穿管座以及固定侧架；所述固定侧架上设置端头固定座，本发明通过固定侧架配合传动机构与穿管座传动连接，在穿管座滑动对散热片进行穿管时通过传动机构同步驱动固定侧架相向移动并配合固定侧架上的端头固定座对散热管端头进行固定，防止穿管座在退出行程时因为摩擦力带动散热管在散热片上滑动出现移位，提高穿管的稳定性。