本发明涉及一种特异性识别绿色魏斯氏菌的ssDNA适配体及其筛选方法和应用，筛选方法包括以下步骤：构建随机文库及引物对，以绿色魏斯氏菌为正筛选菌株，以植物乳杆菌、短乳杆菌、肠膜明串珠菌、戊糖片球菌和金黄色葡萄球菌为反筛选菌株，排除特异性较低的序列，通过牛血清白蛋白和tRNA排除非特异性结合的序列，筛选得到ssDNA文库；对筛选得到的ssDNA文库进行测序，选择结构稳定且自由能较低的序列，再筛选出对绿色魏斯氏菌具有高亲和力和高特异性的序列，得到特异性识别绿色魏斯氏菌的ssDNA适配体。本发明的ssDNA适配体在准确、快速、灵敏检测绿色魏斯氏菌方面具有潜在的应用前景。