本发明公开了一种防倒流的蓝藻围隔收集装置及其使用方法，现提出如下方案，防倒流的蓝藻围隔收集装置包括位于河道内的连接臂，所述连接臂内滑动连接有滑动臂，所述连接臂的顶部设有用于使滑动臂从连接臂中滑出的传动组件，所述滑动臂内设有用于防止蓝藻回流的阻挡组件，本发明结构简单，操作方便，通过启动驱动电机能够使连接臂和滑动臂向两侧滑动，进而使连接臂和滑动臂贴合在河道的两侧，完成对河道内蓝藻的围隔，简单方便，无需人工操作，而且在连接臂滑动的同时，能够使第一挡板和第二挡板保持与滑动臂和连接臂的垂直状态，进而能够防止蓝藻出现回流。