本发明公开了一种用于回旋加速器的超导磁体系统和具有其的回旋加速器，超导磁体系统包括：低温装置，低温装置包括制冷机和低温容器组件，低温容器组件包括磁体容器端、连接传送管段和冷源容器端，连接传送管段连接并连通在磁体容器端和冷源容器端之间；超导装置，超导装置包括超导线圈，超导线圈设于磁体容器端内且适于浸泡于磁体容器端的液态冷却介质或气态冷却介质中；保护模块，保护模块与超导线圈相连，保护模块用于在超导装置失超时保护超导线圈。根据本发明的用于回旋加速器的超导磁体系统，可以保证低温装置的系统稳定性，减少超导线圈对制冷机和设于冷源容器端的各种电器部件的电磁干扰，降低对磁屏蔽的需求，简化结构，降低成本。